Diario del proyecto Флора России | Flora of Russia

24 de octubre de 2021

Новая модель автоматического распознавания видов: запущен обсчёт

Дорогие друзья!

Позавчера iNaturalist сообщил о начале обсчёта новой модели распознавания видов. Она будет включать 47 000 видов, что на 9 000 больше, чем сейчас. Точнее, не видов, а таксонов, поскольку иногда для обучения используются рода или семейства, в которых виды пока не преодолели пороговые значения по объему накопленных данных.

Обещано несколько небольших, но важных технических новшеств, которые позволят улучшить качество автоматических определений и скорость формирования и выхода новых моделей. Оригинальный пост от Алекса Шепарда (@alexshepard) с некоторыми подробностями тут.

Разумеется, нам снова захотелось понять, какие виды флоры России будут включены в их число. В июле, когда вышла текущая модель, мы провели сходную работу. В этот раз был использован тот же протокол действий, а значит результаты можно сравнивать.

Почему это важно для нашего сообщества? После выхода прошлой модели мы затеяли уникальный эксперимент по целенаправленному поиску и документации видов, которым чуть-чуть не хватает до включения в модель. Так появилась копилка "Флоры России". Каждый раз, когда проект "Флора России" достигал очередной круглой отметки, мы обновляли списки видов в копилке. Это принесло свои плоды: мы успели достигнуть пороговой отсечки в 100 наблюдений по нескольким сотням видам. Теперь уже точно известно, что ещё 469 видов флоры России будут включены в новую модель, выход которой ожидается весной.

Очень важно отметить, что когда вид впервые включается в модель, для её обучения используются только наблюдения, определённые людьми - авторами находок и (или) экспертами. Соответственно, именно первый обучающий набор данных, несмотря на небольшой объем фотоматериалов, является самым чистым в плане правильности определений. В дальнейшем, волей или неволей, к нему примешиваются фотографии, в определении которых может принимать участие сама модель.

Для обучения новой модели будет использоваться не более 5 фотографий из одного наблюдения, даже если их было загружено больше (сейчас лимит составляет 20 фотографий на одно наблюдение).

Все цифры ниже даны на 7.10.2021 включительно - на следующий день был запущен обсчёт модели.


ОБЩАЯ ЧАСТЬ

На iNaturalist имеются наблюдения 122 869 видов сосудистых растений. В среднем (есть взять данные WCVP/POWO, World Plants и Leipzig List) во флоре мира насчитывается 350 000 видов сосудистых растений, а это значит, что на iNaturalist представлено уже 35% мировой флоры.

Более 100 наблюдений всех категорий имеются у 17 422 видов сосудистых растений. Именно порог в 100 наблюдений является минимальным условием для включения в модель автоматического распознавания. Минимальным, но не единственным. В этот раз из модели будут полностью исключены гибриды (возможно, их вернут в будущем). Таким образом, остаётся 17 292 вида мировой флоры.

Если у вида есть 100 наблюдений, но нет 50 проверяемых наблюдений (все наблюдения, кроме "обыкновенных"), то они также не входят в модель. Таких видов 198 штук. Остаётся 17 094 видов сосудистых растений, которые и войдут в весеннюю модель (5% мировой флоры или 14% того, что есть на iNaturalist).

Казалось бы, это совсем немного. Но эти виды охватывают 27 809 360 наблюдений из 29 454 764 по всем сосудистым растениям. Т.е. потенциально 94,4% реально наблюдаемых растений должны быть знакомы системе. Это цифры по миру. Давайте посмотрим, что у нас в России.


РОССИЯ

В нашем проекте "Флора России" 7560 видов - это 60,5% от общей оценки видового богатства страны (оценка Р.В. Камелина). Ещё около 1000 видов есть в бэклоге, но пока не верифицированы. Впрочем, это сугубо экспертная оценка.

Из них в модель, которая сейчас обсчитывается, будет включено как минимум 3149 видов (41,7%), что на 469 видов / 6% больше, чем в прошлой модели, которой мы сейчас пользуемся (в ней 2680 видов, т.е. 36% к моменту релиза). Это существенно больше, чем среднемировой показатель (5%).

Пересчитаем на наблюдения. Если бы новая модель заработала прямо сейчас, то ей потенциально должны были быть известны 1 457 440 наблюдений из 1 515 817 штук (96,1%), что на 1,6% больше, чем в прошлой модели, которой мы сейчас пользуемся (она потенциально покрывала на момент выхода 94,5% наблюдений). Этот показатель чуть-чуть (на 1,7%) больше мирового.


РЕГИОНАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

В июле в связи с выходом действующей модели мы посчитали для 12 региональных флор, сколько видов и сколько наблюдений она потенциально накрывает в каждом из субъектов. Мы взяли следующие регионы, по которым, с одной стороны, много наблюдений, а с другой стороны, они показывают хорошую пространственную неоднородность флоры России. Это были:

Алтайский край
Брянская область
Дагестан
Иркутская область
Камчатка
Краснодарский край
Красноярский край
Крым
Москва
Приморский край
Республика Алтай
Свердловская область

Давайте сравним результаты, которые обещает будущая модель против статистики нынешней модели.

Цифры, данные ниже - это доли видов, которые входят в модель, от общего списка видов, имеющихся в соответствующем региональном проекте. Сравниваются две модели: текущая (вышла в июле) и будущая (начало обсчёта - октябрь).

Алтайский край: 75,6 - 81,0
Брянская область: 91,9 - 92,6
Дагестан: 49,5 - 55,3
Иркутская область: 67,7 - 74,7
Камчатка: 64,0 - 70,6
Краснодарский край: 68,3 - 73,6
Красноярский край: 62,0 - 68,8
Крым: 65,8 - 72,2
Москва: 90,1 - 89,9
Приморский край: 46,2 - 53,3
Республика Алтай: 57,0 - 65,0
Свердловская область: 82,1 - 84,0

Максимальный прирост по доле потенциально узнаваемых видов будет по Республике Алтай (+8,0% видов), Приморскому краю (+7,1% видов) и Иркутской области (+7,0% видов).

Следующее сравнение - по доле потенциально накрываемых моделью наблюдений, входящих в соответствующий региональный проект. Тут также сравниваются две модели: текущая (вышла в июле) и будущая (начало обсчёта - октябрь).

Алтайский край: 92,9 - 95,2
Брянская область: 99,3 - 98,9
Дагестан: 61,1 - 68,6
Иркутская область: 89 - 94,2
Камчатка: 82,4 - 89,6
Краснодарский край: 83,7 - 89,6
Красноярский край: 75,5 - 80,7
Крым: 83,4 - 92,1
Москва: 99,7 - 99,1
Приморский край: 52,7 - 64,3
Республика Алтай: 76,6 - 85,5
Свердловская область: 97,4 - 97,9

Максимальный прирост по доле потенциально узнаваемых наблюдений будет по Приморскому краю (+11,6% наблюдений), Республике Алтай (+8,9% наблюдений) и Крыму (+8,7% наблюдений). Сразу за ними идут Дагестан (+7,5%) и Камчатка (+7,2%). Небольшое сокращение долей по Брянской области и Москве связано с исключением гибридов из модели.


КОПИЛКА

Ещё летом как раз для того, чтобы привлечь внимание к видам флоры России, которые в ближайшие месяцы могут дополнить модель автоматического распознавания, мы запустили копилку "Флоры России". В ней собраны данные по 300 видам-кандидатам. По этим растениям нужно набрать минимум 100 наблюдений. С июля по начало октября мы успели вынуть из нашей копилки 469 видов флоры России! Фантастический результат, друзья!

По вновь сформированным спискам пришлось полностью перенастроить таксономические фильтры нашей копилки. Сейчас в ней снова 300 видов, по каждому из которых в системе есть от 73 до 99 наблюдений. Для включения в следующую модель (обсчёт начнётся, вероятно, в конце весны) им нужно как и раньше набрать 100 наблюдений.

Как работает копилка? Весной, летом и осенью, когда растения доступны для распознавания, стоит внимательно посмотреть какие виды растут непосредственно в том месте, где вы находитесь. Нужно попробовать выявить их популяции и сделать такое число наблюдений, чтобы они были включены в модель. Всю зиму копилка будет пополняться архивными фотографиями.

Виды, которые будут при этом достигать отсечки в 100 наблюдений, будут исключаться из нее. Так, в период с 08 по 23 октября уже 12 видов, которые не успели попасть в новую обсчитываемую модель, прошли рубеж в 100 наблюдений:

Viola gmeliniana Фиалка Гмелина
Erodium stephanianum Аистник Стефана
Coronilla coronata Вязель корончатый
Lathyrus pannonicus Чина венгерская
Rubus hirtus Ежевика щетинистая
Veronica agrestis Вероника пашенная
Iris variegata Ирис пёстрый
Atriplex oblongifolia Лебеда продолговатолистная
Huperzia serrata Баранец пильчатый
Alyssum hirsutum Бурачок шершавый
Chenopodium opulifolium Марь калинолистная
Cleistogenes squarrosa Змеёвка растопыренная

Очень надеемся, что к следующей модели мы снова вынем из копилки 400-500 видов флоры нашей страны.

Ingresado el 24 de octubre de 2021 por apseregin apseregin | 0 comentarios | Deja un comentario

23 de octubre de 2021

1 525 000 !!!

Дорогие друзья! Dear all!
Небольшая напоминалка: после табличек в конце поста есть дайджест основных событий, там много обновлений. Не забудьте с ним ознакомиться!
На счётчике сегодня 1 525 000 наблюдений в проекте "Флора России"! Для очередных 25 тыс. наблюдений нашему сообществу потребовалось 17 дней 4 часа (в прошлый раз на 25 тысяч ушло 13,5 дней). За последние 18 дней число наблюдателей флоры России выросло на 264 человека, а число выявленных и подтверждённых видов увеличилось на 13 таксонов в условиях активной чистки номенклатуры (спасибо нашему новому куратору @convallaria1128).
We've got another milestone on the counter - 1,525,000 observations in the "Flora of Russia" project! For the 25-thousandth mark, our community spent 17 days 4 hours (comparing to 13.5 days for previous 25K). During these days, the number of observers of the flora of Russia increased by 264 folks. We've got 13 new identified and confirmed species due to active cleaning of nomenclature (thanks to new iNat curator @convallaria1128).
За последние 18 суток сразу 674 человека из 16,5 тыс. наблюдателей смогли выйти на улицу, сделать хотя бы одно наблюдение в природе и загрузить его на iNaturalist. В этот раз доля свежих полевых наблюдений составила 35% (против 65%, поступивших из ранних архивов пользователей или вытащенных экспертами из бэклога).
Over the past 18 days, 674 people have been able to go outside, make at least a single observation in nature and upload it to iNaturalist. This time, the proportion of fresh field observations was 35% versus 65% that came from early archives or pulled by the experts from the backlog.
Давайте снова зафиксируем статистику для истории.
1 525 000 наблюдений наш проект достиг 23 октября 2021 г. около 13:45 MSK.
The project reached 1,525,000 observations in October 23, 2021 at 13:45 MSK.
● Статистика проекта | Project stats:
1 525 294 наблюдений - 7 560 видов - 6 055 экспертов - 16 473 наблюдателя
● Статистика бэклога | Backlog stats:
295 666 наблюдений - 6 915 видов - 2 250 экспертов - 11 730 наблюдателей
● Статистика по культурным растениям | Stats on cultivated plants:
105 210 наблюдений - 4 472 вида - 1 959 экспертов - 14 022 наблюдателя
● Статистика забракованных данных | Stats of gray zone (bad data):
13 142 наблюдения - 2 271 вид - 701 эксперт - 3 249 наблюдателей
С прошлого замера проект вырос на 25,3 тыс. наблюдений, а антипроект впервые с весны сократился - в это раз на 1,7 тыс. наблюдений. Что это значит? Совершенно верно! Наступает то самое время, когда самые терпеливые могут начинать выкладывать свои огромные архивы и запасники. Оно продлится до весны: несколько месяцев бэклог будет сокращаться, а доля верифицированных наблюдений расти.
Как и прежде мы благодарны всем, кто ставит галочку "В культуре" для снятых культивируемых растений. Пожалуйста, прочитайте специальный релиз, посвященный загрузке 100 000-го наблюдения культурной флоры России.

Ссылки на страницы нашего сообщества:

Традиционные таблички даны ниже.

1. Самые активные участники (число наблюдений) | Top-observers (number of observations)

Место | Rank Пользователь | User Наблюдений | Observations Видов | Species
1 @apseregin 47711 2218
2 @dni_catipo 19682 998
3 @katerina_kashirina 19427 1444
4 @panasenkonn 18562 1131
5 @svetlana-bogdanovich 17015 1572
6 @melodi_96 15952 1124
7 @taimyr 15952 1665
8 @npz 14986 680
9 @velibortravoved 14588 711
10 @vladimir_teplouhov 14278 540
11 @a-lapin 13570 793
12 @convallaria1128 13225 1596
13 @smsergey 12397 803
14 @eduard_garin 11966 938
15 @nikolaydorofeev 11831 885
16 @sapsan 11513 1495
17 @alex_iosipenko 11230 650
18 @yaroslav_magazov 11229 626
19 @vadim_prokhorov 10878 1216
20 @ledum 10780 2058
21 @allaverkhozina 10696 1018
22 @aleksandrebel 10519 1167
23 @dryomys 10436 791
24 @julia_shner 10170 792
25 @sokolkov2002 9838 798
26 @pavel_golyakov 9495 982
27 @alzov 9414 865
28 @tatyanazarubo 8666 776
29 @dinanesterkova 8443 769
30 @olga2019kuryakova 8363 556
31 @yurii_basov 8284 801
32 @max_сarabus 8280 591
33 @svetlanakutueva 8081 537
34 @anastasiiamerkulova 7927 1070
35 @borisbolshakov 7391 644
36 @aleks-khimin 7169 729
37 @kiramarch 7044 693
38 @prokhozhyj 7022 646
39 @urij777 7001 872
40 @ninacourlee 6980 694

2. Самые активные участники (число видов) | Top-observers (number of species)

Место | Rank Пользователь | User Наблюдений | Observations Видов | Species
1 @apseregin 47711 2218
2 @ledum 10780 2058
3 @ramazan_murtazaliev 3622 1813
4 @taimyr 15952 1665
5 @convallaria1128 13225 1596
6 @svetlana-bogdanovich 17015 1572
7 @sapsan 11513 1495
8 @mallaliev 6066 1453
9 @katerina_kashirina 19427 1444
10 @vvolkotrub 3720 1423
11 @lenatara 5729 1389
12 @gen_ok 4631 1311
13 @demons1312 2453 1309
14 @phlomis_2019 4944 1251
15 @elenasuslova 5040 1219
16 @vadim_prokhorov 10878 1216
17 @svdudov 2246 1199
18 @aleksandrebel 10519 1167
19 @panasenkonn 18562 1131
20 @melodi_96 15952 1124
21 @pyakai 2135 1077
22 @anastasiiamerkulova 7927 1070
23 @petr_kosachev 3294 1054
24 @mihail13 1998 1027
25 @allaverkhozina 10696 1018
26 @daba 5643 1004
27 @dni_catipo 19682 998
28 @dinasafina 4049 982
29 @pavel_golyakov 9495 982
30 @alopecurus 6354 963
31 @eduard_garin 11966 938
32 @birdchuvashia 4629 935
33 @vladimirarkhipov 1943 903
34 @nikolaydorofeev 11831 885
35 @kildor 6892 882
36 @natalia_gamova 2521 877
37 @urij777 7001 872
38 @ocanire 4353 871
39 @alzov 9414 865
40 @ev_sklyar 4224 859

3. Статистика региональных проектов (наблюдения) | Regional projects' stats (observations)

Место | Rank Проект | Project Наблюдений | Observations
1 Флора Подмосковья | Moscow Oblast Flora 136207
2 Флора Москвы | Flora of Moscow 129567
3 Флора Иркутской области | Irkutsk Oblast Flora 64689
4 Флора Крыма | Flora of the Crimea 60197
5 Флора Брянской области | Bryansk Oblast Flora 59495
6 Флора Курской области | Kursk Oblast Flora 50535
7 Флора Тульской области | Tula Oblast Flora 49631
8 Флора Свердловской области | Sverdlovsk Oblast Flora 48916
9 Флора Новосибирской области | Novosibirsk Oblast Flora 46798
10 Флора Нижегородской области | Nizhny Novgorod Oblast Flora 39736
11 Флора Алтайского края | Altai Krai Flora 36801
12 Флора Мордовии | Flora of Mordovia 36279
13 Флора Севастополя | Sevastopol Flora 35444
14 Флора Воронежской области | Voronezh Oblast Flora 32348
15 Флора Татарстана | Tatarstan Flora 29499
16 Флора Челябинской области | Chelyabinsk Oblast Flora 29490
17 Флора Владимирской области | Vladimir Oblast Flora 28974
18 Флора Башкирии | Bashkortostan Flora 27894
19 Флора Омской области | Omsk Oblast Flora 27762
20 Флора Камчатки | Kamchatka Flora 26994
21 Флора Ярославской области | Yaroslavl Oblast Flora 25957
22 Флора Чувашии | Chuvash Republic Flora 25099
23 Флора Краснодарского края | Krasnodar Krai Flora 24091
24 Флора Калининградской области | Kaliningrad Oblast Flora 22187
25 Флора Костромской области | Kostroma Oblast Flora 21194
26 Флора Югры | Flora of Khanty-Mansi Autonomous Okrug 19503
27 Флора Тверской области | Tver Oblast Flora 18471
28 Флора Ленинградской области | Leningrad Oblast Flora 17417
29 Флора Самарской области | Samara Oblast Flora 16715
30 Флора Приморского края | Primorsky Krai Flora 16561
31 Флора Санкт-Петербурга | St Petersburg Flora 16522
32 Флора Саратовской области | Saratov Oblast Flora 15188
33 Флора Тюменской области | Tyumen Oblast Flora 14376
34 Флора Калужской области | Kaluga Oblast Flora 14074
35 Флора Красноярского края | Krasnoyarsk Krai Flora 13778
36 Флора Пензенской области | Penza Oblast Flora 13348
37 Флора Дагестана | Dagestan Flora 13012
38 Флора Бурятии | Buryat Republic Flora 12471
39 Флора Республики Алтай | Altai Republic Flora 12254
40 Флора Белгородской области | Belgorod Oblast Flora 11840
41 Флора Пермского края | Perm Krai Flora 11825
42 Флора Томской области | Tomsk Oblast Flora 11229
43 Флора Кемеровской области | Kemerovo Oblast Flora 9243
44 Флора Кировской области | Kirov Oblast Flora 8300
45 Флора Рязанской области | Ryazan Oblast Flora 7491
46 Флора Волгоградской области | Volgograd Oblast Flora 6219
47 Флора Мурманской области | Murmansk Oblast Flora 6179
48 Флора Ставрополья | Stavropol Krai Flora 5990
49 Флора Ульяновской области | Ulyanovsk Oblast Flora 5959
50 Флора Удмуртии | Udmurt Republic Flora 5827
51 Флора Новгородской области | Novgorod Oblast Flora 5764
52 Флора Карелии | Flora of Karelia 5754
53 Флора Ямало-Ненецкого АО | Flora of Yamalo-Nenets Autonomous Okrug 5751
54 Флора Псковской области | Pskov Oblast Flora 5688
55 Флора Ростовской области | Rostov Oblast Flora 5597
56 Флора Липецкой области | Lipetsk Oblast Flora 4998
57 Флора Тамбовской области | Tambov Oblast Flora 4618
58 Флора Архангельской области | Arkhangelsk Oblast Flora 4486
59 Флора Северной Осетии | Flora of North Ossetia 4420
60 Флора Карачаево-Черкесии | Flora of Karachay-Cherkessia 4288
61 Флора Магаданской области | Magadan Oblast Flora 4271
62 Флора Марий Эл | Mari El Flora 4084
63 Флора Сахалинской области | Sakhalin Oblast Flora 3914
64 Флора Хакасии | Flora of Khakassia 3677
65 Флора Смоленской области | Smolensk Oblast Flora 3669
66 Флора Курганской области | Kurgan Oblast Flora 3372
67 Флора Амурской области | Amur Oblast Flora 3283
68 Флора Оренбургской области | Orenburg Oblast Flora 2970
69 Флора Вологодской области | Vologda Oblast Flora 2906
70 Флора Ивановской области | Ivanovo Oblast Flora 2871
71 Флора Забайкальского края | Zabaykalsky Krai Flora 2654
72 Флора Якутии | Flora of Yakutia 2641
73 Флора Астраханской области | Astrakhan Oblast Flora 2206
74 Флора Адыгеи | Flora of Adygea 1833
75 Флора Коми | Komi Republic Flora 1826
76 Флора Кабардино-Балкарии | Flora of Kabardino-Balkaria 1750
77 Флора Тувы | Tyva Republic Flora 1519
78 Флора Орловской области | Oryol Oblast Flora 1434
79 Флора Чукотки | Flora of Chukotka 1328
80 Флора Хабаровского края | Khabarovsk Krai Flora 1174
81 Флора Калмыкии | Flora of Kalmykia 704
82 Флора Чечни | Chechen Republic Flora 402
83 Флора Еврейской АО | Flora of Jewish Autonomous Oblast 309
84 Флора Ненецкого АО | Flora of Nenets Autonomous Okrug 173
85 Флора Ингушетии | Flora of Ingushetia 94

4. Топ-наблюдатели за 18 дней (по числу видов) | 18-days top-observers (species)

Место | Rank Пользователь | User Наблюдений | Observations Видов | Species
1 @nikolaydorofeev 299 143
2 @smsergey 297 133
3 @svetlana-bogdanovich 141 118
4 @vyacheslavluzanov 246 118
5 @a-lapin 209 105
6 @alopecurus 175 102
7 @daba 194 95
8 @nk2305 146 90
9 @svetlanakutueva 205 87
10 @serycherny 91 78
11 @tanniii66 100 78
12 @allaverkhozina 94 75
13 @naturalist57011 104 75
14 @mariakohanovskaya 89 74
15 @anastasiiamerkulova 86 68
16 @taimyr 75 65
17 @urij777 80 63
18 @alex_iosipenko 103 62
19 @stepan_lomako 64 62
20 @prokhozhyj 137 60
21 @eugenia_urusova 81 59
22 @wrrite 92 59
23 @elenasuslova 94 58
24 @bakkasv 74 57
25 @vladimirbakutov 65 57
26 @yuriydanilevsky 75 57
27 @tatyanazarubo 72 55
28 @alex_dyubanov 75 53
29 @bogdan_mag 68 52
30 @roman_romanov 98 52
31 @forestru 101 51
32 @tbsilaeva 55 50
33 @anatolipomortsev 64 49
34 @barbashin_daniil 56 48
35 @solodilova_olga 118 48
36 @khanyuy_chzhan 63 47
37 @borisbolshakov 50 46
38 @alexey_yabs 87 45
39 @anya_malchenkova 46 45
40 @kirill_kuptsov 50 44

5. Топ-поставщики видов за 18 дней (поле + архив) | 18-days top species uploaders (field & archives)

Место | Rank Пользователь | User Наблюдений | Observations Видов | Species
1 @taimyr 775 388
2 @apseregin 729 347
3 @convallaria1128 648 264
4 @nikolaydorofeev 596 260
5 @panasenkonn 300 230
6 @smsergey 433 195
7 @aleksandrebel 287 190
8 @allaverkhozina 637 174
9 @svetlana-bogdanovich 142 118
10 @vyacheslavluzanov 246 118
11 @alopecurus 216 113
12 @alex_iosipenko 217 111
13 @cambala 143 110
14 @a-lapin 209 105
15 @cava 129 101
16 @daba 196 97
17 @nk2305 146 90
18 @anatolipomortsev 162 89
19 @svetlanakutueva 205 87
20 @oleg_kosterin 166 85
21 @alexopalev 160 81
22 @serycherny 91 78
23 @tanniii66 100 78
24 @wrrite 115 78
25 @pyakai 79 76
26 @naturalist57011 104 75
27 @roman_romanov 156 75
28 @mariakohanovskaya 89 74
29 @egoshina 81 73
30 @madmanserg 80 73
31 @yuriydanilevsky 91 70
32 @anastasiiamerkulova 86 68
33 @olga_chernyagina 67 64
34 @stepan_lomako 67 64
35 @urij777 80 63
36 @bakkasv 84 62
37 @prokhozhyj 137 60
38 @zefirka 81 60
39 @eugenia_urusova 81 59
40 @kildor 81 59

6. Самые активные эксперты для загруженных за 18 дней наблюдений (поле + архив) | Top-experts for the last 18-days uploads (field & archives)

Место | Rank Пользователь | User Определений | IDs
1 @julia_shner 3258
2 @apseregin 1276
3 @madmanserg 1095
4 @aleks-khimin 1062
5 @phlomis_2019 1032
6 @igor_kuzmin 900
7 @mallaliev 818
8 @daba 699
9 @svg52 672
10 @smsergey 546
11 @sergeyprokopenko 447
12 @elena_pismarkina 398
13 @vladimirbakutov 338
14 @eduard_garin 333
15 @anastasiiamerkulova 272
16 @convallaria1128 260
17 @davydovbotany 253
18 @anatolipomortsev 251
19 @vadim_prokhorov 213
20 @allaverkhozina 182
ТЕКУЩИЕ ТЕМЫ:
● У проекта "Флора России" появился адрес в зоне ru: https://flora.depo.msu.ru.
● Пару недель назад (8.10.2021) на iNaturalist заряжен обсчёт новой модели автоматического распознавания видов, который займёт несколько месяцев. Она будет включать уже 47 000 видов. Сами модели планируется релизить дважды в год.
● Ещё летом как раз для того, чтобы привлечь внимание к видам флоры России, которые в ближайшие месяцы могут дополнить модель автоматического распознавания, мы запустили копилку "Флоры России" - в ней собраны данные по 300 видам-кандидатам. По этим растениям нужно набрать минимум 100 наблюдений. С июля по начало октября мы успели вынуть из нашей копилки несколько сотен видов флоры России! Фантастический результат, друзья! Виды в копилке постоянно обновляются, чтобы было веселее: так, за последние 18 дней еще 13 видов прошли пороговую отметку и были заменены (они войдут уже в осеннюю модель следующего года). Присоединяйтесь! Весеннюю модель обещают сделать гораздо более компетентной. Будем ждать с нетерпением.
● Победителями конкурса "Белые пятна" для стимулирования сбора данных по флоре отстающих регионов стали Елена Андриянова, Геннадий Окатов и Андрей Пяк.
● Ещё раз обращаем внимание на "серую зону" и спасаем свои наблюдения. У активных наблюдателей из-за различных технических сбоев туда что-нибудь да попадает. Подробности по ссылке.
● На днях были обновлены данные из iNaturalist в Global Biodiversity Information Facility (GBIF). О том, что такое GBIF и почему это важно написано здесь.
● В МГУ мы читаем межфакультетский курс для небиологов по iNaturalist. Все лекции мы выкладываем на наш канал в YouTube, у которого уже 133 подписчика. Ожидается, что к концу года мы запишем 11 или 12 лекций. Подробности по ссылке.
● Приглашаем всех участников iNaturalist подписываться не только на проект МГУ "Флора России", но и на региональные страницы этого портала, на антипроект (бэклог) и "серую зону". В паспорте каждого наблюдения будет, таким образом, отражена как ссылка на общероссийский проект (в т.ч. ещё до определения или при съемке культурных растений), так и региональная принадлежность наблюдения. О том, что такое "серая зона", написано в специальном посте.
Для написания данного поста использован конвертер текстовых и табличных данных, который осуществляет разметку текста. Конвертер разработал Константин Романов (@kildor). Если у вас есть свои проекты, то вам эта ссылка, уверен, пригодится!
Ingresado el 23 de octubre de 2021 por apseregin apseregin | 0 comentarios | Deja un comentario

16 de octubre de 2021

Свежие данные GBIF (15 октября 2021 г.)

Дорогие друзья!

Постепенно к сообществу проекта "Флора России" присоединяются всё новые пользователи. Изредка мы рассказываем о том, как взаимодействуют iNaturalist и GBIF. Пост месячной давности тут: https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-russia/journal/56284-svezhie-dannye-gbif-7-sentyabrya-2021-g .

Итак, Global Biodiversity Information Facility (https://www.gbif.org/) - это глобальная платформа-агрегатор данных о биоразнообразии. Их здесь очень много: 1 891 733 741 фактов присутствия того или иного вида в той или иной точке. Это и наблюдения, и образцы, и окаменелости, и данные литературы. Чтобы все эти данные оказались доступны в одном месте, 1747 организаций по всему миру объединили здесь свои 62 595 баз данных - больших и малых. Российские организации (университеты, академические институты, музеи, ООПТ) опубликовали в GBIF 542 базы данных.

Любой пользователь может освоить несложную поисковую систему GBIF (https://www.gbif.org/occurrence/search) и найти то, что ему интересно. Система поисковых фильтров GBIF отличается богатым выбором настроек и стремительным отображением результатов, несмотря на гигантские объемы данных. Мой опыт показывает, что искать здесь отдельные наблюдения гораздо быстрее, чем на iNaturalist. Кроме того, удобно, следуя гиперссылкам, исправлять определение какой-нибудь случайной ошибки из числа наблюдений iNat, прошедших в GBIF.

Конечно, среди баз данных о биоразнообразии есть очень большие массивы! Вот, как выглядит сейчас десятка самых больших:

1) EOD – eBird Observation Dataset 872 206 403
2) Artportalen (Swedish Species Observation System) 82 017 115
3) Observation.org, Nature data from around the World 39 969 765
4) iNaturalist Research-grade Observations 34 983 593
5) DOF - Observations from the Danish Ornithological Society 27 335 045
6) Norwegian Species Observation Service 25 963 444
7) INPN - Données flore des CBN agrégées par la FCBN 20 999 334
8) Southern African Bird Atlas Project 2 17 847 718
9) USGS PWRC - Bird Banding Lab - US State Centroid - 1960-2010 14 079 367
10) Waarnemingen.be - Bird occurrences in Flanders and the Brussels Capital Region, Belgium 12 811 851

А вот как выглядит другая десятка - с данными по сосудистым растениям.

1) INPN - Données flore des CBN agrégées par la FCBN 20 960 245
2) Artportalen (Swedish Species Observation System) 14 230 807
3) iNaturalist Research-grade Observations 13 356 321
4) Dutch Vegetation Database 11 108 843
5) The Danish Environmental Portal, species and habitats-database "Danmarks Miljøportals Naturdatabase" 10 851 858
6) Pl@ntNet automatically identified occurrences 9 634 639
7) Flora von Deutschland (Phanerogamen) 9 255 906
8) BSBI data from several English counties, up to 2015 8 158 299
9) Flore du Bassin parisien (CBNBP) 7 781 823
10) Floristic records from survey studies of the Bayerisches Landesamt für Umwelt 7 131 328

Как видно из обоих списков, данные из iNaturalist являются одним из ведущих источников данных в GBIF - как по всем группам живых организмов (4-е место), так и по сосудистым растениям (3-е место). И эти данные постоянно растут. По прогнозам и динамике, iNat выйдет на второе место по сосудистым растениям уже в этом году, а в следующем году станет первым. И нашему сообществу предстоит сыграть в этом ключевую роль.

На iNaturalist 83,0 млн "проверяемых" наблюдений, а в GBIF попадает лишь 35,0 млн (https://doi.org/10.15468/ab3s5x). Почему? Дело в том, что одновременно:

  • наблюдение должно иметь исследовательский статус;
  • наблюдение должно иметь открытую лицензию (CC0, CC-BY, CC-BY-NC);
  • а сами данные при этом публикуются с задержкой (сейчас данные от 7.10.2021).

Давайте сравним две ссылки на одно и то же наблюдение:

https://www.gbif.org/occurrence/3017963860
https://www.inaturalist.org/observations/67518248

Автор не указал своего полного имени в профиле, поэтому в GBIF он числится как "Denis". Так что стоит указать полное имя в профиле в соответствующем разделе (лучше латиницей!). Автором определения значится в GBIF Игорь Поспелов, поскольку он первый указал правильное название вида. Ссылка на автора определения нормируется с помощью номера ORCID, который каждый пользователь может привязать в своем личном кабинете. В паспорте наблюдения на iNaturalist есть ссылка на GBIF ("Это наблюдение размещено на 1 сайте: GBIF"), обратная ссылка на сайте GBIF имеется с момента заливки.

У GBIF своя номенклатура (так называемый "GBIF Backbone"), которая автоматически стыкуется с названиями iNat, а также имеется в расширенном поиске фильтр по автору находки, так что можете выбрать и посмотреть, какие ваши наблюдения попали в GBIF. Недавно там появился поиск по административным единицам (правда, карта заложена 10-летней давности, так что границы Москвы и Подмосковья, например, старые).

Если вы хотите, чтобы ваши наблюдения попали в GBIF, то необходимо удостовериться, что у вас выставлена открытая лицензия. Это можно сделать как через сайт, так и через приложение в настройках учётной записи. Если у вас не проставлена лицензия, то в карточке каждого наблюдения у вас в правом нижнем углу написано "Все права защищены", если проставлена, то, как правило, - "Некоторые права защищены".

Отдельно отметим, что все топ-100 наблюдателей проекта "Флора России" перешли на свободные лицензии. Доля наблюдений проекта, заблокированных жёсткими лицензиями, сократилась сейчас до рекордной отметки в 10,1%! Это наше большое общее достижение в деле открытого доступа к данным о биоразнообразии. Большое спасибо, что не оставили без внимания предыдущие посты о GBIF. Возможно, в этот раз отклик будет еще шире.

Зачем всё это нужно?

Самый простой ответ заключается в том, что именно из GBIF исследователи выгружают данные о растениях, грибах и животных в удобном виде (csv-выгрузки). Каждая такая выгрузка получает doi, с помощью которого отслеживаются цитирования в научных исследованиях. Так, массив данных iNaturalist (https://doi.org/10.15468/ab3s5x ) процитирован через GBIF уже 1859 раз! Это рекорд среди всех участников GBIF.


РОССИЯ

На данный момент в GBIF индексируется уже 7,73 млн записей о биоразнообразии России - 7,53 млн с основной территории и 0,20 млн из Крыма. При этом, iNaturalist является самым большим по объему источником данных о природе России (занимает долю 25,9% по основной территории и 51,3% по Крыму). Эта доля постоянно растёт благодаря нашим усилиям.

Вот, какие массивы данных по биоразнообразию России являются крупнейшими сегодня:

1) iNaturalist Research-grade Observations 1 951 884
2) Moscow University Herbarium (MW) 667 248
3) RU-BIRDS.RU, Birds observations database from Russia and neighboring regions. Zoological Museum of M.V. Lomonosov Moscow State University. 497 108
4) EOD – eBird Observation Dataset 387 883
5) Locations of plants on dot distribution maps in the Flora of Siberia (Flora Sibiraea, 1987–1997) 169 854
6) FLORUS: miscellaneous records 141 294
7) Flora of Vladimir Oblast, Russia: an updated grid dataset (1867–2020) 130 054
8) Finnish Floristic Database (Finnish Museum of Natural History Collections) 106 396
9) Birds of Northern Eurasia 86 992
10) Chronicle of Nature - Phenology of Plants of Zhiguli Nature Reserve 86 524

А вот, что есть в GBIF по сосудистым растениям России:

1) iNaturalist Research-grade Observations 1 266 897
2) Moscow University Herbarium (MW) 594 983
3) Locations of plants on dot distribution maps in the Flora of Siberia (Flora Sibiraea, 1987–1997) 169 854
4) FLORUS: miscellaneous records 141 294
5) Flora of Vladimir Oblast, Russia: an updated grid dataset (1867–2020) 130 054
6) Finnish Floristic Database (Finnish Museum of Natural History Collections) 106 241
7) Chronicle of Nature - Phenology of Plants of Zhiguli Nature Reserve 86 524
8) MHA Herbarium: collections of vascular plants 80 031
9) Pl@ntNet automatically identified occurrences 71 567
10) A global database for the distributions of crop wild relatives 69 255

P.S. Если у кого-то есть электронные таблицы с надёжными данными о встречах живых организмов, которые не пролезают на iNaturalist, то в принципе мы можем помочь с их публикацией в GBIF. Это могут быть данные геоботанических описаний, каталоги коллекций, флористические списки и проч. Пишите на почту botanik.seregin@gmail.com

Ingresado el 16 de octubre de 2021 por apseregin apseregin | 1 comentario | Deja un comentario

15 de octubre de 2021

Нужна помощь сообщества для Цифрового гербария МГУ (образцы ГБС РАН): коллектор и дата

Дорогие друзья!

Если у вас есть время, силы и желание, то нам всё ещё нужна ваша помощь во вводе простых данных для Цифрового гербария МГУ (https://plant.depo.msu.ru/). Сегодня Цифровой гербарий МГУ - это консорциум девяти организаций, публикующих на единой платформе изображения своих гербарных материалов в виде базы данных.

Ровно две недели назад некоторые из вас уже приняли участие в подобной работе: https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-russia/journal/57543-nuzhna-pomosch-soobschestva-dlya-tsifrovogo-gerbariya-mgu-obraztsy-gbs-ran-kollektor-i-data . Низкий поклон всем участникам этого процесса! Невостребованными остались образцы из нескольких регионов: Ростовская область, Нижняя Волга, Северо-Запад, Эстония, Молдавия, Украина. К сожалению, растения из этих мест оказались никому не интересны.

Исходники: сканы отдела Восточной Европы Гербария ГБС РАН (MHA), доступные в интернете (например, такой: https://plant.depo.msu.ru/public/scan.jpg?pcode=MHA0044114). Залиты в Цифровой гербарий МГУ 13.09.2021.

Задача этапа - открывая изображение по гиперссылке, в простую xlsx-таблицу с пустыми столбиками напротив каждого образца написать:

1) Дату сбора (вводится в отдельные поля: день, месяц, год). Если указан диапазон (например, 6-8.07.2012), то вводим целочисленную часть (ММ = 7, ГГГГ = 2012), а в примечаниях пишем "Дата дана диапазоном: 6-8.07.2012".

2) Коллектор вводится только первый (если их несколько). Именно так, как в этикетке - инициалы могут быть до фамилии, после фамилии, с одной буквой или с двумя. Ровно как в этикетке. (Подсказка: коллектор сопровождается словами: Leg., Coll., собр. и проч. (это и означает "коллектор") или просто написана фамилия). Главное не спутать с тем, кто определял.

3) Если сначала у коллектора идут инициалы, то перед фамилией всегда ставим пробел, а между инициалами - нет (например, "А.П. Хохряков", а не "А.П.Хохряков" и не "А. П. Хохряков"). Если сбор анонимный, пишем "anonymous", если подпись плохо читается, то пишем "[неразборчиво]".

4) Также для свежих образцов, в которых указаны географические координаты, мы пишем слово "да" в столбике "Координаты?", если они указаны (таких образцов будет немного).

На этом этапе можно заказать выбрать следующие регионы: Ростовская область, Нижняя Волга (пустыни, степи), Северо-Запад, Эстония, Молдавия, Украина. Если по ошибке вам случайно попадутся образцы из другого региона (мы их частично вводили автоматически по результатам OCR), то мы также вводим коллектора и дату, но в примечаниях пишем настоящий регион.

Ввод пары коллектор-дата для новых сканов позволит автоматически снабдить геопривязками (точкой с географическими координатами) большинство образцов благодаря алгоритму ИСТРА, реализованному в Цифровом гербарии МГУ.

Заданий осталось не очень много, но мы постараемся поделить их по частям между желающими. Минимальная партия - всего 200 образцов. Сканы качественные, а потому могут загружаться небыстро. Впрочем, есть вторая гиперссылка на более лёгкий скан. Соответственно, скорость ввода данных отчасти зависит от скорости интернета.

Если вы готовы помочь, то пишите, пожалуйста, на почту botanik.seregin@gmail.com и выбирайте регион по своему вкусу.


Всем большое спасибо!

Ingresado el 15 de octubre de 2021 por apseregin apseregin | 0 comentarios | Deja un comentario

11 de octubre de 2021

Результаты конкурса "Белые пятна" 2021 года

Дорогие друзья!

Как вы знаете, с 1 марта по 30 сентября 2021 года проходил наш конкурс "Белые пятна" для стимулирования сбора данных по флоре отстающих регионов. В нём принимали участие наблюдения сосудистых растений из следующих регионов: Еврейская АО, Ингушетия, Калмыкия, Магаданская область, Ненецкий АО, Северная Осетия, Тува, Хабаровский край, Чукотка, Якутия. Загрузка материалов конкурса закончилась 5 октября, были опубликованы технические результаты.

Строго согласно положению, с 6 по 10 октября 2021 года жюри Конкурса из числа сотрудников МГУ имени М.В. Ломоносова, которые являются активными участниками проекта «Флора России», основываясь на статистических и пространственных данных, вынесли коллегиальное экспертное решение о победителе и призёрах. Победитель и призёры Конкурса не выявлялись только по числу сделанных наблюдений или по числу выявленных видов. Были экспертно оценены географическое размещение сделанных наблюдений, продолжительность и системность работ, видовой состав находок и общий вклад полученных данных в выявление географической картины флоры России.

Членами жюри выступили:

@antennaria (Ксения Вячеславовна Дудова, к.б.н., МГУ, биологический факультет)
@apseregin (Алексей Петрович Серегин, д.б.н., МГУ, биологический факультет)
@convallaria1128 (Дмитрий Александрович Бочков, МГУ, биологический факультет)
@elenasuslova (Елена Германовна Суслова, к.г.н., МГУ, географический факультет)
@julia_shner (Юлия Вячеславовна Шнер, МГУ, биологический факультет)
@katerina_kashirina (Екатерина Сергеевна Каширина, к.г.н., МГУ, Филиал в г. Севастополь, факультет естественных наук)
@natalia_gamova (Наталья Сергеевна Гамова, МГУ, биологический факультет)
@phlomis_2019 (Сергей Робертович Майоров, к.б.н., МГУ, биологический факультет)
@svdudov (Сергей Валерьевич Дудов, к.г.н., МГУ, биологический факультет)

Как и ожидалось, участников конкурса было мало, однако они собрали много новых данных по флоре слабо представленных регионов. Каждый из членов жюри проставил участникам призовые места (от 1 до 3), которые они заняли по итогам конкурса. В итоговых списках от членов жюри было три участника: @elena_andriyanova (Елена Андриянова, статистика), @gen_ok (Геннадий Окатов, статистика), @pyakai (Андрей Пяк, статистика).

Вот какие места выставил участникам каждый из членов жюри:

@elena_andriyanova 1 1 1 1 2 2 2 3 2
@gen_ok   2 2 2 2 1 1 1 1 3
@pyakai 3 3 3 3 3 3 3 2 1

По итогам суммирования полученных оценок от каждого из членов жюри нам удалось установить обладателя третьего места, а вот в борьбе за победу у двух участников абсолютно равные показатели. Поскольку борьба заняла семь месяцев и наш итоговый протокол не выявил победителя, то мы приняли решение объявить победителями сразу двух участников, разделив сумму призовых за первое и второе место поровну.

Первое место: @elena_andriyanova и @gen_ok
Третье место: @pyakai

Наши призёры:

Елена Андриянова (слева), Геннадий Окатов (в центре), Андрей Пяк (справа).

Поздравляем участников! Низкий поклон за многомесячные труды и многочисленные наблюдения! Пожалуйста, напишите на botanik.seregin@gmail.com для уточнения деталей выплаты призовых средств.

Ingresado el 11 de octubre de 2021 por apseregin apseregin | 1 comentario | Deja un comentario

10 de octubre de 2021

2500 подписчиков !!!

Дорогие друзья!

Мы взяли новый рубеж - в проекте "Флора России" теперь 2500 подписчиков!

В связи с появлением новых участников нашего сообщества, самое время рассказать ещё раз поподробнее о структуре проекта.


"Флора России" изначально была задумана как портал для автоматического анализа верифицированных данных региональных проектов по сосудистым растениям России. Это был стандартный "зонтичный" проект на iNaturalist, который объединял ровно 85 региональных проектов - один на каждый субъект.

Ещё весной проект "Флора России | Flora of Russia" прошёл отметку в 1 000 000 наблюдений, а незадолго до этого достиг технологического потолка платформы. Из-за этого примерно в середине марта 2021 года главная страница портала перестала загружаться. Мы решили перевернуть страницу и сделать небольшой ребрендинг.

Итак, современная структура сообщества "Флора России" на iNaturalist такова:

1) Старый проект "Флора России", который включает определённые и верифицированные наблюдения, состоит из 85 региональных порталов, а его главная страница не загружается. Однако именно тут находится подробное описание проекта со всеми ссылками и продолжает вестись наш бортовой журнал. Именно у старого проекта 2500 подписчиков.

2) Новая "Флора России" - это "плоский" проект без региональной структуры, который загружается стремительно как на сайте, так и через приложение. Прежде всего, мы используем его как актуальное табло со статистикой, как общей, так и по видам, наблюдателям и экспертам.

3) На смену неработающему табло региональных проектов пришли три "полузонтика" со статистикой регионов: табло регионов (первая часть), табло регионов (вторая часть), табло регионов (третья часть). Число наблюдений неуклонно растёт, поэтому даже при делении на три части эти страницы с трудом получают всю нужную статистику из базы, а поэтому вам придётся перезагрузить каждую из них несколько раз, чтобы табло регионов отобразилось.

4) Потеряшки "Флоры России" - это такой небольшой проект, который включает около 100-150 определённых и верифицированных наблюдений, которые случайно не попали в региональные порталы. Это происходит из-за: (1) слишком большого радиуса привязки наблюдений, (2) несовершенства шейп-файлов регионов, (3) намеренного искажения или загрубления координат или радиусов, (4) привязки к административным единицам, а не к конкретным точкам.

5) Антипроект (бэклог) "Флоры России" включает неопределённые и неверифицированные наблюдения и является важнейшей точкой входа для наших экспертов. Бэклог завис пока на отметке в 300 000 наблюдений после активного сезона, но не перешагнул её. Как правило, число наблюдений в нём сокращается с сентября по апрель и растёт в тёплое время года.

6) "Серая зона" включает наблюдения культурных растений и забракованные данные, т.е. наблюдения, не отвечающие формальным критериям качества. Мы благодарны всем, кто ставит галочку "Культурное" для снятых культивируемых растений. Пожалуйста, прочитайте специальный релиз, посвященный загрузке 100 000-го наблюдения культурной флоры России.

7) И, наконец, у нас есть копилка "Флоры России". Её история такова: несколько месяцев назад вышла новая модель автоматического распознавания видов iNaturalist. Она включает около 38 000 видов, в т.ч. 2680 видов флоры России. Для того, чтобы привлечь внимание сообщества к видам, которые в ближайшие месяцы могут дополнить модель, мы и запустили копилку. В ней собраны данные по 300 видам-кандидатам. По этим растениям нужно набрать минимум 100 наблюдений. Виды в копилке постоянно обновляются - мы исключаем из неё виды, преодолевшие пороговую отметку и добавляем новые.

По сути, это такие же проекты, к которым можно присоединяться. Шильдик каждой из этих страниц автоматически будет появляться на странице каждого вашего наблюдения, если оно отвечает параметрам проекта. Так что подписывайтесь!


Данные для "Атласа флоры России" экспортируются в GBIF. Пожалуйста, в настройках профиля указывайте свободные лицензии (CC0, CC BY, CC BY-NC). О том, как это сделать рассказно здесь. Кстати: каждый из топ-100 наблюдателей проекта уже перешёл на открытые лицензии.

Чтобы узнать больше о сообществе "Флора России" на iNaturalist, стоит изучить более детальное описание проекта.

Ingresado el 10 de octubre de 2021 por apseregin apseregin | 0 comentarios | Deja un comentario

09 de octubre de 2021

Субботник по разбору "Неизвестного": осталось немного

Дорогие друзья!

В прошлое воскресенье мы провели субботник, который дал прекрасный результат. В итоге в категории "Неизвестно" резко сократилось число наблюдений из России, которые нужно подписать хотя бы до крупной группы: цветковые растения, бабочки, лишайники, грибы, птицы и проч. Впрочем, она ещё не опустела окончательно, да и за последнюю неделю сюда кое-что накапало.

Вот текущая ссылка. К ней можно добавлять, например, дополнительные региональные фильтры.

Просьба быть очень внимательным и учитывать следующие особенности:

1) Список включает не только не подписанные наблюдения (категория "Неизвестно"), но и наблюдения редких групп (например, вирусы, бактерии и проч.), которые автоматически помещаются в эту категорию, а также наблюдения, которые невозможно отнести даже к какому-либо царству (помечены как "Жизнь").

2) При определении в левом верхнем углу рядом с надписью "Неизвестно" иногда есть надпись серым шрифтом (например, "Заполнитель: бобовые"). Просьба копировать эту надпись в комментарий, иначе она пропадёт. Это мнение наблюдателя, в котором часто таится ключик к тому, что имел ввиду автор.

3) Также обращайте внимание на имеющиеся комментарии. Очень внимательно смотрите на категорию "Жизнь", поскольку автору фото, в этом случае, может быть интересен, не лист, упавший с дерева, а белый налёт мучнистой росы на этом листе.

4) Традиционные просьбы: отмечайте культурные растения, сообщайте авторам о потерянных запчастях, а, закончив одну страничку, нажимайте на кнопочку "Отметить все как проверенные".

Цель этого этапа: закончить разбор наблюдений без единого определения (категория "Неизвестно") по таксономическим группам, включив их, таким образом, в научный оборот. Как и прежде, большая часть не подписанных завалов - именно сосудистые растения.

Главный принцип: не уверен, пропускай.

Ingresado el 09 de octubre de 2021 por apseregin apseregin | 2 comentarios | Deja un comentario

06 de octubre de 2021

1 500 000 наблюдений !!! 1000 дней !!!

Дорогие друзья! Dear all!
На счётчике сегодня знаменательная отметка - 1 500 000 наблюдений в проекте "Флора России"! Для очередных 25 тыс. наблюдений нашему сообществу потребовалось 13,5 дней (в прошлый раз на 25 тысяч ушло 10 дней). За последние 14 дней число наблюдателей флоры России выросло на 154 человека, а число выявленных и подтверждённых видов увеличилось всего на 3 таксона благодаря активной чистке номенклатуры.
We've got an astonishing milestone on the counter - 1,500,000 observations in the "Flora of Russia" project! For the 25-thousandth mark, our community spent 13.5 days (comparing to 10 days for previous 25K). During these days, the number of observers of the flora of Russia increased by 154 folks. We've got only 3 new identified and confirmed species due to active cleaning of nomenclature.
100 000, 26 июня 2019 г. в 14:41 MSK
500 000, 26 июня 2020 г. в 06:06 MSK
1 000 000, 4 мая 2021 г. в 9:15 MSK
1 500 000, 6 октября 2021 г. в 9:35 MSK
Юбилейное наблюдение было сделано Константином Романовым (@kildor) в окрестностях Новосибирска. Это тростник обыкновенный (Phragmites australis), сфотографированный еще 27 сентября и загруженный на платформу утром 6 октября 2021 г.
Примечательный полуторамиллионный рубеж совпал с другим знаковым юбилеем. Наш проект появился 9 января 2019 г., а это значит, что вчера (6.10.2021 г.) ему исполнилось ровно 1000 дней. Нетрудно подсчитать, что, стартовав с отметки в 8 тыс. наблюдений, наш проект по флоре России растёт в среднем на 1492 верифицированных наблюдения в день (чуть больше 1 наблюдения в минуту). Разумеется, растёт не сам по себе, а благодаря активной ежедневной работе тысяч наблюдателей и сотен экспертов. Низкий поклон каждому из вас!
Небольшая напоминалка: после табличек в конце поста есть дайджест основных событий, там много обновлений. Не забудьте с ним ознакомиться!
За последние 14 суток сразу 549 человек из 16,2 тыс. наблюдателей смогли выйти на улицу, сделать хотя бы одно наблюдение в природе и загрузить его на iNaturalist. В этот раз доля свежих полевых наблюдений составила 30% (против 70%, поступивших из ранних архивов пользователей или вытащенных экспертами из бэклога).
Over the past 14 days, 549 people have been able to go outside, make at least a single observation in nature and upload it to iNaturalist. This time, the proportion of fresh field observations was 30% versus 70% that came from early archives or pulled by the experts from the backlog.
Давайте снова зафиксируем статистику для истории.
1 500 000 наблюдений наш проект достиг 6 октября 2021 г. в 9:35 MSK (спасибо, @prokhozhyj, за точный хронометраж).
The project reached 1,500,000 observations in October 6, 2021 at 9:35 MSK.
● Статистика проекта | Project stats:
1 500 028 наблюдений - 7 547 видов - 5 995 экспертов - 16 209 наблюдателей
● Статистика бэклога | Backlog stats:
297 386 наблюдений - 6 957 видов - 2 234 эксперта - 11 561 наблюдатель
● Статистика по культурным растениям | Stats on cultivated plants:
103 342 наблюдения - 4 443 вида - 1 948 экспертов - 13 828 наблюдателей
● Статистика забракованных данных | Stats of gray zone (bad data):
13 053 наблюдения - 2 255 видов - 693 эксперта - 3 214 наблюдателей
С прошлого замера проект вырос на 25,1 тыс. наблюдений, а антипроект вырос на 2,2 тыс. наблюдений. Мы благодарны всем, кто ставит галочку "В культуре" для снятых культивируемых растений. Пожалуйста, прочитайте специальный релиз, посвященный загрузке 100 000-го наблюдения культурной флоры России.

Ссылки на страницы нашего сообщества:

Традиционные таблички в расширенном формате в честь юбилея даны ниже.

1. Самые активные участники (число наблюдений) | Top-observers (number of observations)

Место | Rank Пользователь | User Наблюдений | Observations Видов | Species
1 @apseregin 46 948 2 213
2 @dni_catipo 19 617 998
3 @katerina_kashirina 19 343 1 441
4 @panasenkonn 18 087 1 119
5 @svetlana-bogdanovich 16 763 1 559
6 @melodi_96 15 850 1 119
7 @npz 14 958 679
8 @taimyr 14 840 1 428
9 @velibortravoved 14 570 710
10 @vladimir_teplouhov 14 173 540
11 @a-lapin 13 304 786
12 @convallaria1128 12 517 1 589
13 @smsergey 11 911 795
14 @eduard_garin 11 908 936
15 @sapsan 11 472 1 494
16 @nikolaydorofeev 11 152 856
17 @yaroslavmagazov 10 968 620
18 @vadim_prokhorov 10 878 1 217
19 @alex_iosipenko 10 861 642
20 @ledum 10 777 2 057
21 @dryomys 10 436 792
22 @aleksandrebel 10 211 1 159
23 @julia_shner 10 164 788
24 @allaverkhozina 9 904 1 010
25 @sokolkov2002 9 709 797
26 @pavel_golyakov 9 451 982
27 @alzov 9 414 865
28 @tatyanazarubo 8 571 772
29 @dinanesterkova 8 439 768
30 @olga2019kuryakova 8 362 555
31 @max_сarabus 8 264 590
32 @yurii_basov 8 095 783
33 @svetlanakutueva 7 812 533
34 @anastasiiamerkulova 7 785 1 061
35 @borisbolshakov 7 360 643
36 @aleks-khimin 7 057 730
37 @kiramarch 7 007 691
38 @ninacourlee 6 888 667
39 @urij777 6 873 865
40 @alebedev 6 849 638
41 @prokhozhyj 6 838 643
42 @olegdavydov 6 818 440
43 @kildor 6 768 880
44 @zefirka 6 725 597
45 @alopecurus 6 071 952
46 @mallaliev 6 008 1 451
47 @hapugin88 5 965 667
48 @wrrite 5 922 754
49 @vist 5 733 640
50 @lenatara 5 630 1 386
51 @alexanderdubynin 5 608 571
52 @divitre 5 492 538
53 @fedor_kondrachuk 5 457 555
54 @daba 5 367 995
55 @lex_deineko 5 300 624
56 @oleg_kosterin 5 047 717
57 @elenasuslova 4 981 1 221
58 @zibzap 4 967 735
59 @anna_efimova 4 948 742
60 @phlomis_2019 4 912 1 249
61 @denis_tishin 4 853 569
62 @anatolipomortsev 4 621 622
63 @birdchuvashia 4 582 934
64 @gen_ok 4 579 1 307
65 @maglove 4 483 518
66 @sergilus 4 347 450
67 @antennaria 4 331 738
68 @ocanire 4 325 868
69 @lilia_efimtseva 4 306 498
70 @dmitriy_kuklin-volfson 4 276 561
71 @disertinsky 4 234 683
72 @tls-60 4 191 447
73 @ev_sklyar 4 175 856
74 @vadim66 4 162 655
75 @mashat 4 143 442
76 @cambala 4 130 829
77 @dinasafina 4 044 981
78 @maxim_ismaylov 3 982 406
79 @ikskyrskobl 3 916 542
80 @achertok 3 775 718
81 @tatyana-omck 3 767 417
82 @vvolkotrub 3 720 1 423
83 @elena_andriyanova 3 699 545
84 @naturalist16000 3 626 835
85 @ramazan_murtazaliev 3 613 1 811
86 @veronika_belova 3 573 668
87 @lilia_rakitianskaia 3 512 604
88 @cava 3 499 634
89 @vaglazunov 3 384 688
90 @madmanserg 3 383 651
91 @v199rus 3 304 423
92 @marina-privalova 3 298 777
93 @beerolha 3 279 622
94 @evelina_ishmukhametova 3 257 507
95 @tanniii66 3 230 538
96 @petr_kosachev 3 229 1 048
97 @vladimirov 3 216 655
98 @aquacielo 3 196 787
99 @tomegatherion 3 174 728
100 @tatyanapopova 3 161 566
101 @hln_m_t 3 121 426
102 @evgenyboginsky 2 973 414
103 @naturalist38499 2 963 584
104 @krylenkosl 2 896 524
105 @nikolai_nakonechnyi 2 854 349
106 @alexey_yabs 2 731 606
107 @fyodorkhomenko 2 712 649
108 @viktoriabilous 2 669 433
109 @vladimir_korotkov 2 668 726
110 @svg52 2 639 448
111 @alexeiebel 2 610 667
112 @vladimirbakutov 2 525 453
113 @natalia_gamova 2 521 877
114 @naturalist35399 2 483 470
115 @forestru 2 476 346
116 @irinasavenko 2 463 405
117 @yuriysokolov73 2 451 606
118 @margosha 2 412 465
119 @vikaryabkova 2 367 437
120 @mariakohanovskaya 2 329 498
121 @demons1312 2 322 1 234
122 @andreyefremov 2 299 855
123 @woodmen19 2 283 563
124 @sansan_94 2 268 394
125 @millione 2 266 410
126 @svdudov 2 245 1 198
127 @tsvetasheva 2 229 672
128 @merlu 2 226 706
129 @naturalist25051 2 207 709
130 @naturalist8307 2 207 474
131 @tbsilaeva 2 203 584
132 @andreymoskvichev 2 196 412
133 @olga_chernyagina 2 177 634
134 @marina_sad 2 137 624
135 @domir 2 133 375
136 @tatyaya 2 120 457
137 @andrewins 2 091 478
138 @deniselin 2 080 557
139 @valentina_kostina 2 075 542
140 @pyakai 2 054 1 053
141 @denis_shilov 2 044 631
142 @alexanderlakomov 2 021 545
143 @evgeniy_benikhanov 2 020 542
144 @mihail13 1 994 1 027
145 @gerda_new 1 964 470
146 @plrays 1 961 526
147 @kuzmenckin 1 956 641
148 @vladimirarkhipov 1 935 900
149 @elena_pismarkina 1 925 646
150 @naturalist29626paterikina 1 894 408
151 @marinavs 1 888 387
152 @stepangrebnev2005 1 886 436
153 @ankhen 1 883 490
154 @aleksey_baushev 1 850 598
155 @vladimirtravkin 1 843 349
156 @pushai 1 836 493
157 @irine_shlojmis 1 782 432
158 @elena_tikhonova 1 780 536
159 @biflab 1 766 553
160 @sergeyprokopenko 1 759 611
161 @irinaber 1 720 474
162 @tatiana_moscow 1 716 434
163 @syastrebova 1 686 438
164 @tn61 1 685 371
165 @epopov 1 684 711
166 @igor_kuzmin 1 682 350
167 @julia_medvedko 1 674 455
168 @zemleved 1 647 513
169 @dmitriy_philippov 1 599 451
170 @kgrebennikov 1 599 305
171 @mitrula_paludosa 1 570 384
172 @lola73 1 565 382
173 @sergeyus 1 545 294
174 @cat_arch_angel 1 528 350
175 @krivosheev 1 506 440
176 @repta 1 496 509
177 @a-travva 1 495 581
178 @svetlana_katana 1 474 554
179 @dakileno 1 470 538
180 @natalya1406 1 469 339
181 @valentin_kosterin 1 467 247
182 @naturalist34144 1 463 399
183 @kosienkov_konstantin 1 461 247
184 @ana_lu 1 441 590
185 @nadezhda12 1 437 291
186 @pavloviv 1 432 730
187 @ggularijants 1 400 757
188 @evgenyi_eg 1 379 383
189 @ivanovdg19 1 369 612
190 @sergejseleznev 1 362 534
191 @naturalist57011 1 361 386
192 @zviruha 1 351 277
193 @radik_kutushev 1 349 447
194 @studavtor_irina 1 334 285
195 @fedascheva 1 323 334
196 @yuriydanilevsky 1 307 521
197 @goncholgaj 1 306 499
198 @alexfamilyteam 1 281 407
199 @vyacheslavluzanov 1 273 448
200 @gyng 1 264 537

2. Самые активные участники (число видов) | Top-observers (number of species)

Место | Rank Пользователь | User Наблюдений | Observations Видов | Species
1 @apseregin 46 948 2 213
2 @ledum 10 777 2 057
3 @ramazan_murtazaliev 3 613 1 811
4 @convallaria1128 12 517 1 589
5 @svetlana-bogdanovich 16 763 1 559
6 @sapsan 11 472 1 494
7 @mallaliev 6 008 1 451
8 @katerina_kashirina 19 343 1 441
9 @taimyr 14 840 1 428
10 @vvolkotrub 3 720 1 423
11 @lenatara 5 630 1 386
12 @gen_ok 4 579 1 307
13 @phlomis_2019 4 912 1 249
14 @demons1312 2 322 1 234
15 @elenasuslova 4 981 1 221
16 @vadim_prokhorov 10 878 1 217
17 @svdudov 2 245 1 198
18 @aleksandrebel 10 211 1 159
19 @panasenkonn 18 087 1 119
20 @melodi_96 15 850 1 119
21 @anastasiiamerkulova 7 785 1 061
22 @pyakai 2 054 1 053
23 @petr_kosachev 3 229 1 048
24 @mihail13 1 994 1 027
25 @allaverkhozina 9 904 1 010
26 @dni_catipo 19 617 998
27 @daba 5 367 995
28 @pavel_golyakov 9 451 982
29 @dinasafina 4 044 981
30 @alopecurus 6 071 952
31 @eduard_garin 11 908 936
32 @birdchuvashia 4 582 934
33 @vladimirarkhipov 1 935 900
34 @kildor 6 768 880
35 @natalia_gamova 2 521 877
36 @ocanire 4 325 868
37 @urij777 6 873 865
38 @alzov 9 414 865
39 @nikolaydorofeev 11 152 856
40 @ev_sklyar 4 175 856
41 @andreyefremov 2 299 855
42 @naturalist16000 3 626 835
43 @cambala 4 130 829
44 @sokolkov2002 9 709 797
45 @smsergey 11 911 795
46 @dryomys 10 436 792
47 @julia_shner 10 164 788
48 @aquacielo 3 196 787
49 @a-lapin 13 304 786
50 @yurii_basov 8 095 783
51 @marina-privalova 3 298 777
52 @tatyanazarubo 8 571 772
53 @dinanesterkova 8 439 768
54 @ggularijants 1 400 757
55 @wrrite 5 922 754
56 @anna_efimova 4 948 742
57 @antennaria 4 331 738
58 @zibzap 4 967 735
59 @pavloviv 1 432 730
60 @aleks-khimin 7 057 730
61 @tomegatherion 3 174 728
62 @vladimir_korotkov 2 668 726
63 @nliks 1 035 720
64 @achertok 3 775 718
65 @oleg_kosterin 5 047 717
66 @epopov 1 684 711
67 @velibortravoved 14 570 710
68 @naturalist25051 2 207 709
69 @merlu 2 226 706
70 @kiramarch 7 007 691
71 @vaglazunov 3 384 688
72 @a_teimurov 1 218 685
73 @disertinsky 4 234 683
74 @npz 14 958 679
75 @tsvetasheva 2 229 672
76 @veronika_belova 3 573 668
77 @hapugin88 5 965 667
78 @ninacourlee 6 888 667
79 @alexeiebel 2 610 667
80 @vadim66 4 162 655
81 @vladimirov 3 216 655
82 @madmanserg 3 383 651
83 @fyodorkhomenko 2 712 649
84 @elena_pismarkina 1 925 646
85 @prokhozhyj 6 838 643
86 @borisbolshakov 7 360 643
87 @alex_iosipenko 10 861 642
88 @kuzmenckin 1 956 641
89 @vist 5 733 640
90 @alebedev 6 849 638
91 @cava 3 499 634
92 @olga_chernyagina 2 177 634
93 @denis_shilov 2 044 631
94 @marina_sad 2 137 624
95 @lex_deineko 5 300 624
96 @anatolipomortsev 4 621 622
97 @beerolha 3 279 622
98 @yaroslavmagazov 10 968 620
99 @ivanovdg19 1 369 612
100 @sergeyprokopenko 1 759 611
101 @alexey_yabs 2 731 606
102 @yuriysokolov73 2 451 606
103 @lilia_rakitianskaia 3 512 604
104 @aleksey_baushev 1 850 598
105 @zefirka 6 725 597
106 @sergei_kazanovsky 1 100 596
107 @ana_lu 1 441 590
108 @max_сarabus 8 264 590
109 @naturalist38499 2 963 584
110 @tbsilaeva 2 203 584
111 @a-travva 1 495 581
112 @denis_ivanov 1 119 580
113 @alexanderdubynin 5 608 571
114 @ivan_savinov 949 569
115 @denis_tishin 4 853 569
116 @tatyanapopova 3 161 566
117 @woodmen19 2 283 563
118 @dmitriy_kuklin-volfson 4 276 561
119 @deniselin 2 080 557
120 @fedor_kondrachuk 5 457 555
121 @olga2019kuryakova 8 362 555
122 @svetlana_katana 1 474 554
123 @biflab 1 766 553
124 @sultanov-rinat 669 547
125 @alexanderlakomov 2 021 545
126 @elena_andriyanova 3 699 545
127 @valentina_kostina 2 075 542
128 @evgeniy_benikhanov 2 020 542
129 @ikskyrskobl 3 916 542
130 @vladimir_teplouhov 14 173 540
131 @tanniii66 3 230 538
132 @divitre 5 492 538
133 @dakileno 1 470 538
134 @gyng 1 264 537
135 @elena_tikhonova 1 780 536
136 @sergejseleznev 1 362 534
137 @svetlanakutueva 7 812 533
138 @plrays 1 961 526
139 @krylenkosl 2 896 524
140 @yuriydanilevsky 1 307 521
141 @maglove 4 483 518
142 @zemleved 1 647 513
143 @repta 1 496 509
144 @evelina_ishmukhametova 3 257 507
145 @s_chere 879 501
146 @goncholgaj 1 306 499
147 @lilia_efimtseva 4 306 498
148 @mariakohanovskaya 2 329 498
149 @vladimirkurilo 1 168 497
150 @pushai 1 836 493
151 @ankhen 1 883 490
152 @eugenezakharov 1 231 483
153 @rovzap 1 037 480
154 @andrewins 2 091 478
155 @saranchine 1 105 476
156 @tatiana_karpenko 892 476
157 @irinaber 1 720 474
158 @naturalist8307 2 207 474
159 @gerda_new 1 964 470
160 @naturalist35399 2 483 470
161 @denis_m 715 470
162 @margosha 2 412 465
163 @naturalist49367 1 260 460
164 @tatyaya 2 120 457
165 @nikolay_sobolev 1 115 457
166 @alex_pol_64 656 457
167 @vera_chistyakova 1 048 455
168 @julia_medvedko 1 674 455
169 @vladimirbakutov 2 525 453
170 @vikula_bludov 1 102 453
171 @dmitriy_philippov 1 599 451
172 @sergilus 4 347 450
173 @naturalist7664 908 449
174 @svg52 2 639 448
175 @vyacheslavluzanov 1 273 448
176 @tls-60 4 191 447
177 @radik_kutushev 1 349 447
178 @mashat 4 143 442
179 @nadya9 517 440
180 @olegdavydov 6 818 440
181 @krivosheev 1 506 440
182 @syastrebova 1 686 438
183 @vikaryabkova 2 367 437
184 @stepangrebnev2005 1 886 436
185 @siburhan 1 251 435
186 @tatiana_moscow 1 716 434
187 @viktoriabilous 2 669 433
188 @aleksandr_levon 553 432
189 @irine_shlojmis 1 782 432
190 @nadya_n 654 431
191 @hln_m_t 3 121 426
192 @mikhail_bobylev 1 142 423
193 @v199rus 3 304 423
194 @rejoin 788 421
195 @liana_ishmuhametova 1 023 418
196 @tatyana-omck 3 767 417
197 @evgenyboginsky 2 973 414
198 @andrey_358 616 413
199 @andreymoskvichev 2 196 412
200 @andrewbazdyrev 778 411

3. Статистика региональных проектов (наблюдения) | Regional projects' stats (observations)

Место | Rank Проект | Project Наблюдений | Observations
1 Флора Подмосковья | Moscow Oblast Flora 133 779
2 Флора Москвы | Flora of Moscow 126 652
3 Флора Иркутской области | Irkutsk Oblast Flora 62 231
4 Флора Крыма | Flora of the Crimea 59 072
5 Флора Брянской области | Bryansk Oblast Flora 58 630
6 Флора Курской области | Kursk Oblast Flora 50 037
7 Флора Тульской области | Tula Oblast Flora 48 891
8 Флора Свердловской области | Sverdlovsk Oblast Flora 48 414
9 Флора Новосибирской области | Novosibirsk Oblast Flora 46 480
10 Флора Нижегородской области | Nizhny Novgorod Oblast Flora 38 849
11 Флора Алтайского края | Altai Krai Flora 36 295
12 Флора Мордовии | Flora of Mordovia 36 063
13 Флора Севастополя | Sevastopol Flora 35 246
14 Флора Воронежской области | Voronezh Oblast Flora 31 934
15 Флора Татарстана | Tatarstan Flora 29 331
16 Флора Челябинской области | Chelyabinsk Oblast Flora 28 820
17 Флора Владимирской области | Vladimir Oblast Flora 28 183
18 Флора Башкирии | Bashkortostan Flora 27 673
19 Флора Омской области | Omsk Oblast Flora 27 502
20 Флора Камчатки | Kamchatka Flora 26 758
21 Флора Ярославской области | Yaroslavl Oblast Flora 25 441
22 Флора Чувашии | Chuvash Republic Flora 24 981
23 Флора Краснодарского края | Krasnodar Krai Flora 23 727
24 Флора Калининградской области | Kaliningrad Oblast Flora 21 906
25 Флора Костромской области | Kostroma Oblast Flora 21 055
26 Флора Югры | Flora of Khanty-Mansi Autonomous Okrug 19 099
27 Флора Тверской области | Tver Oblast Flora 18 385
28 Флора Ленинградской области | Leningrad Oblast Flora 17 267
29 Флора Самарской области | Samara Oblast Flora 16 507
30 Флора Санкт-Петербурга | St Petersburg Flora 16 266
31 Флора Приморского края | Primorsky Krai Flora 15 322
32 Флора Саратовской области | Saratov Oblast Flora 14 764
33 Флора Тюменской области | Tyumen Oblast Flora 14 285
34 Флора Калужской области | Kaluga Oblast Flora 13 819
35 Флора Красноярского края | Krasnoyarsk Krai Flora 13 533
36 Флора Пензенской области | Penza Oblast Flora 13 184
37 Флора Дагестана | Dagestan Flora 12 428
38 Флора Республики Алтай | Altai Republic Flora 12 174
39 Флора Бурятии | Buryat Republic Flora 12 001
40 Флора Белгородской области | Belgorod Oblast Flora 11 717
41 Флора Пермского края | Perm Krai Flora 11 713
42 Флора Томской области | Tomsk Oblast Flora 11 101
43 Флора Кемеровской области | Kemerovo Oblast Flora 9 143
44 Флора Кировской области | Kirov Oblast Flora 8 183
45 Флора Рязанской области | Ryazan Oblast Flora 7 428
46 Флора Волгоградской области | Volgograd Oblast Flora 6 130
47 Флора Мурманской области | Murmansk Oblast Flora 6 130
48 Флора Ульяновской области | Ulyanovsk Oblast Flora 5 954
49 Флора Ставрополья | Stavropol Krai Flora 5 942
50 Флора Удмуртии | Udmurt Republic Flora 5 806
51 Флора Карелии | Flora of Karelia 5 708
52 Флора Псковской области | Pskov Oblast Flora 5 624
53 Флора Новгородской области | Novgorod Oblast Flora 5 622
54 Флора Ростовской области | Rostov Oblast Flora 5 522
55 Флора Ямало-Ненецкого АО | Flora of Yamalo-Nenets Autonomous Okrug 5 522
56 Флора Липецкой области | Lipetsk Oblast Flora 4 988
57 Флора Тамбовской области | Tambov Oblast Flora 4 453
58 Флора Архангельской области | Arkhangelsk Oblast Flora 4 443
59 Флора Северной Осетии | Flora of North Ossetia 4 355
60 Флора Карачаево-Черкесии | Flora of Karachay-Cherkessia 4 254
61 Флора Магаданской области | Magadan Oblast Flora 4 174
62 Флора Марий Эл | Mari El Flora 3 996
63 Флора Сахалинской области | Sakhalin Oblast Flora 3 901
64 Флора Смоленской области | Smolensk Oblast Flora 3 597
65 Флора Хакасии | Flora of Khakassia 3 377
66 Флора Курганской области | Kurgan Oblast Flora 3 362
67 Флора Амурской области | Amur Oblast Flora 3 264
68 Флора Оренбургской области | Orenburg Oblast Flora 2 932
69 Флора Вологодской области | Vologda Oblast Flora 2 899
70 Флора Ивановской области | Ivanovo Oblast Flora 2 867
71 Флора Забайкальского края | Zabaykalsky Krai Flora 2 643
72 Флора Якутии | Flora of Yakutia 2 472
73 Флора Астраханской области | Astrakhan Oblast Flora 2 182
74 Флора Коми | Komi Republic Flora 1 816
75 Флора Адыгеи | Flora of Adygea 1 768
76 Флора Кабардино-Балкарии | Flora of Kabardino-Balkaria 1 718
77 Флора Тувы | Tyva Republic Flora 1 493
78 Флора Орловской области | Oryol Oblast Flora 1 418
79 Флора Чукотки | Flora of Chukotka 1 324
80 Флора Хабаровского края | Khabarovsk Krai Flora 1 156
81 Флора Калмыкии | Flora of Kalmykia 688
82 Флора Чечни | Chechen Republic Flora 381
83 Флора Еврейской АО | Flora of Jewish Autonomous Oblast 304
84 Флора Ненецкого АО | Flora of Nenets Autonomous Okrug 182
85 Флора Ингушетии | Flora of Ingushetia 90

4. Топ-наблюдатели за 14 дней (по числу видов) | 14-days top-observers (species)

Место | Rank Пользователь | User Наблюдений | Observations Видов | Species
1 @svetlana-bogdanovich 551 299
2 @nikolaydorofeev 422 189
3 @wrrite 178 133
4 @daba 230 129
5 @elena_andriyanova 576 129
6 @naturalist25051 168 126
7 @urij777 153 119
8 @tbsilaeva 161 117
9 @svetlanakutueva 291 112
10 @mariakohanovskaya 144 97
11 @a-lapin 148 74
12 @alebedev 145 73
13 @alex_iosipenko 142 70
14 @denis_tishin 151 70
15 @smsergey 82 69
16 @ocanire 61 61
17 @prokhozhyj 133 58
18 @kohab 80 57
19 @anatolipomortsev 109 54
20 @roman_romanov 114 54
21 @melodi_96 81 49
22 @nk2305 60 49
23 @naturalist57011 65 48
24 @saranchine 51 48
25 @elenasoldatova 47 46
26 @alexey_yabs 81 45
27 @vladimir_teplouhov 114 42
28 @naturalist29626paterikina 51 40
29 @naturalist33665 57 40
30 @vladimirbakutov 48 40
31 @eduard_garin 52 39
32 @biflab 42 37
33 @olga2019kuryakova 43 37
34 @zefirka 42 37
35 @serycherny 38 36
36 @mallaliev 37 34
37 @millione 37 34
38 @ludmila-17 36 33
39 @vladimirov 33 33
40 @cambala 48 32
41 @naturalist49367 34 31
42 @olegglushenkov 34 30
43 @velibortravoved 39 30
44 @alopecurus 37 29
45 @melampyrum 30 28
46 @vist 35 27
47 @phlomis_2019 37 26
48 @iwan_soboliew 24 24
49 @naturalist38499 28 23
50 @elenasuslova 26 22
51 @naturalist16000 31 22
52 @nikolai_nakonechnyi 53 22
53 @v199rus 23 22
54 @vera_chistyakova 27 22
55 @aleks-khimin 28 21
56 @anastasiiamerkulova 25 21
57 @igor158 20 19
58 @mongolenok 21 18
59 @roughingit 18 18
60 @stanislav_murashkin 22 18
61 @hln_m_t 19 17
62 @mashat 18 17
63 @lluvlera 16 16
64 @maria_sachkova 16 16
65 @captain_lavrushka 15 15
66 @d_top 15 15
67 @destmord 19 15
68 @igor_b 24 15
69 @kildor 15 15
70 @nikapshe 16 15
71 @aleksey_baushev 19 14
72 @brodaga59 14 14
73 @denis_shilov 17 14
74 @ekaterinagordienko 14 14
75 @tatiana_moscow 14 14
76 @alexeiebel 18 13
77 @alinamelnikova 13 13
78 @lenatara 15 13
79 @tivanik 14 13
80 @tls-60 15 13
81 @vyacheslavluzanov 14 13
82 @innovanews 14 12
83 @naturalist51320 12 12
84 @ohmspectator 14 12
85 @veksha 12 12
86 @elenasyutkina 12 11
87 @forestru 11 11
88 @mariiaarkh 13 11
89 @nadezhdabaglej 12 11
90 @natalia_trifuz 11 11
91 @alexfamilyteam 12 10
92 @anastasiaredflower99 10 10
93 @birdchuvashia 10 10
94 @evgenyboginsky 13 10
95 @helg168bov 11 10
96 @julia_shner 10 10
97 @lilacfly 10 10
98 @naturalist34144 10 10
99 @naturalisttt 27 10
100 @polyabel 10 10

5. Топ-поставщики видов за 14 дней (поле + архив) | 14-days top species uploaders (field & archives)

Место | Rank Пользователь | User Наблюдений | Observations Видов | Species
1 @convallaria1128 1 591 422
2 @apseregin 714 327
3 @svetlana-bogdanovich 551 299
4 @gen_ok 413 268
5 @daba 632 239
6 @nikolaydorofeev 466 202
7 @wrrite 236 173
8 @alex_iosipenko 493 159
9 @smsergey 268 157
10 @naturalist25051 218 155
11 @elena_andriyanova 636 149
12 @aleksandrebel 228 148
13 @annaham 247 142
14 @petr_kosachev 173 132
15 @ocanire 163 131
16 @anatolipomortsev 240 129
17 @svetlanakutueva 360 129
18 @kildor 170 127
19 @tbsilaeva 164 120
20 @urij777 153 119
21 @elenasuslova 160 118
22 @aquacielo 153 109
23 @nina_nesterova 163 106
24 @mariakohanovskaya 144 97
25 @pavloviv 128 97
26 @pyakai 100 94
27 @alexopalev 134 78
28 @taimyr 103 76
29 @a-lapin 148 74
30 @alebedev 145 73
31 @denis_tishin 151 70
32 @olegglushenkov 121 70
33 @zefirka 80 69
34 @madmanserg 73 63
35 @nk2305 73 62
36 @biflab 74 61
37 @prokhozhyj 133 58
38 @kohab 80 57
39 @natalia_trifuz 63 56
40 @roman_romanov 114 54
41 @marina-privalova 51 49
42 @melodi_96 82 49
43 @naturalist57011 65 48
44 @saranchine 51 48
45 @elenasoldatova 47 46
46 @olga2019kuryakova 52 46
47 @alexey_yabs 81 45
48 @alopecurus 56 43
49 @vladimir_teplouhov 119 42
50 @naturalist29626paterikina 53 41
51 @vadim_kirichenko 56 41
52 @birdchuvashia 53 40
53 @hln_m_t 48 40
54 @naturalist33665 57 40
55 @vladimirbakutov 48 40
56 @eduard_garin 52 39
57 @ikskyrskobl 58 39
58 @andrewins 57 38
59 @cambala 52 36
60 @natalya_fomina 43 36
61 @serycherny 38 36
62 @mallaliev 38 35
63 @oleg_kosterin 48 35
64 @cava 37 34
65 @evgeniyaast 34 34
66 @ludmila-17 37 34
67 @millione 37 34
68 @nikolai_nakonechnyi 141 34
69 @vladimirov 33 33
70 @andrey_358 31 31
71 @khomax 35 31
72 @naturalist49367 34 31
73 @irine_shlojmis 36 30
74 @velibortravoved 39 30
75 @melampyrum 31 28
76 @sergilus 36 28
77 @vist 36 28
78 @yuriydanilevsky 38 28
79 @evgeniya_kuzmicheva 31 27
80 @iwan_soboliew 27 27
81 @k_skvortsov 32 27
82 @phlomis_2019 37 26
83 @aurata 26 24
84 @d_top 25 24
85 @naturalist38499 28 23
86 @aleks-khimin 30 22
87 @naturalist16000 31 22
88 @tatyanazarubo 23 22
89 @v199rus 23 22
90 @vera_chistyakova 27 22
91 @anastasiiamerkulova 25 21
92 @forestru 23 21
93 @gerda_new 29 21
94 @nikapshe 22 21
95 @igor158 21 20
96 @naturalist19358 20 20
97 @corylus_avellana 24 19
98 @katerina_kashirina 21 19
99 @mongolenok 21 18
100 @roughingit 18 18

6. Самые активные эксперты для загруженных за 14 дней наблюдений (поле + архив) | Top-experts for the last 14-days uploads (field & archives)

Место | Rank Пользователь | User Определений | IDs
1 @mallaliev 1 816
2 @julia_shner 1 611
3 @phlomis_2019 784
4 @aleks-khimin 736
5 @vladimirbakutov 712
6 @madmanserg 667
7 @naturalist38499 663
8 @daba 646
9 @igor_kuzmin 471
10 @eduard_garin 438
11 @davydovbotany 432
12 @elena_pismarkina 409
13 @borisbolshakov 401
14 @svg52 387
15 @smsergey 315
16 @apseregin 303
17 @vadim_prokhorov 276
18 @mariakhoreva 267
19 @anastasiiamerkulova 222
20 @svetlana-bogdanovich 192
ТЕКУЩИЕ ТЕМЫ:
● У проекта "Флора России" появился адрес в зоне ru: https://flora.depo.msu.ru.
● С 1 марта 2021 г. стартовал конкурс "Белые пятна" для стимулирования сбора данных по флоре отстающих регионов. В нём принимают участие наблюдения сосудистых растений из следующих регионов: Еврейская АО, Ингушетия, Калмыкия, Магаданская область, Ненецкий АО, Северная Осетия, Тува, Хабаровский край, Чукотка, Якутия. Конкурс закончился, опубликованы технические результаты, в выходные мы подведём его итоги.
● Цифровому гербарию МГУ снова нужна помощь волонтёров по вводу простых данных с этикеток: начался второй этап, задания которого выполнены уже на 45%. Очень ждём вашей помощи!. Остались образцы из Черноземья, Среднего и особенно Нижнего Поволжья, Ростовской области, Северо-Запада, Эстонии, Молдавии, Украины.
● Сообщение для профессиональной части нашего сообщества: мы начали глобальную чистку номенклатуры. Если у вас есть нерешенные вопросы по трактовке видов, жгучее желание переименовать латинское название какого-нибудь таксона, что-то решительно вытащить из синонимов или добить подвисший флаг, то такие замечания мы теперь складируем тут. Таксономия iNat основана на POWO, но, во-первых, всё-таки автономна, а потому может быть изменена, а, во-вторых, с редакторами POWO налажен добрый рабочий контакт. Всё в наших руках.
● Мы провели небольшой, но очень полезный воскресный субботник по разбору "Неизвестного". Подробности по ссылке. Пока мёртво висят около 500 никак не подписанных наблюдений с Камчатки. Возможно, такой или похожий субботник придётся повторить.
● Ещё раз обращаем внимание на "серую зону" и спасаем свои наблюдения. У активных наблюдателей из-за различных технических сбоев туда что-нибудь да попадает. Подробности по ссылке.
● В сентябре были обновлены данные из iNaturalist в Global Biodiversity Information Facility (GBIF). О том, что такое GBIF и почему это важно написано здесь. Не забудьте проверить, что у ваших наблюдений стоит одна из свободных лицензий: CC0, CC-BY, CC-BY-NC.
● Приглашаем всех участников iNaturalist подписываться не только на проект МГУ "Флора России", но и на региональные страницы этого портала, на антипроект (бэклог) и "серую зону". В паспорте каждого наблюдения будет, таким образом, отражена как ссылка на общероссийский проект (в т.ч. ещё до определения или при съемке культурных растений), так и региональная принадлежность наблюдения. О том, что такое "серая зона", написано в специальном посте.
● Вышла новая модель автоматического распознавания видов iNaturalist. Она включает около 38 000 видов, в т.ч. 2680 видов флоры России. Для того, чтобы привлечь ваше внимание к видам, которые в ближайшие месяцы могут дополнить модель, мы запустили копилку "Флоры России" - в ней собраны данные по 300 видам-кандидатам. По этим растениям нужно набрать минимум 100 наблюдений. Виды в копилке постоянно обновляются, чтобы было веселее: так, за последние две недели еще 18 (!!!) видов прошли пороговую отметку и были заменены. Присоединяйтесь!
Для написания данного поста использован конвертер текстовых и табличных данных, который осуществляет разметку текста. Конвертер разработал Константин Романов (@kildor). Если у вас есть свои проекты, то вам эта ссылка, уверен, пригодится!
Ingresado el 06 de octubre de 2021 por apseregin apseregin | 3 comentarios | Deja un comentario

05 de octubre de 2021

Кто станет автором полуторамиллионного наблюдения?

Дорогие друзья!

Сегодня проект "Флора России", возможно, преодолеет символическую отметку в 1 500 000 наблюдений! Как обычно в таких случаях мы назовём автора условного юбилейного наблюдения. Загружайте свои наблюдения, осталось совсем чуть-чуть!

Наш проект появился на свет 9 января 2019 г., а это значит, что сегодня ему исполняется ровно 1000 дней (можно проверить тут: https://planetcalc.ru/274/). Вот такая вот магия цифр.

Счётчик наблюдений: https://www.inaturalist.org/projects/new-flora-of-russia-novaya-flora-rossii

Ingresado el 05 de octubre de 2021 por apseregin apseregin | 1 comentario | Deja un comentario

04 de octubre de 2021

Чистка номенклатуры

Дорогие друзья!

Это мини-отчёт по глобальной чистке номенклатуры проекта "Флора России".

Список видов проекта (утилита от @kildor доступна по адресу https://kildor.name/inat/species) общим объемом 7568 названий был выгружен в четверг 30 сентября 2021 г. Самые наблюдательные из вас заметили, что спустя четыре дня (3 октября 2021 г.) число видов на счётчике сократилось до 7538 штук. Подробности этого цикла чистки даны ниже.


Выгруженный список мы прогнали через блок стыковки номенклатуры, который встроен в Цифровой гербарий МГУ (https://plant.depo.msu.ru/). Встроенный модуль с помощью sql-запросов запрашивает данные через api внешних баз, что позволяет: (1) исключить из дальнейшей ручной проверки аккуратно вставшие уникальные названия (таких оказалось 6650 штук, или 88%); (2) найти дублирующие названия и неточности орфографии; (3) проверить список гибридов; (4) отметить виды, которые в других источниках могут считаться таксономическими синонимами.

Задача первого этапа: найти номенклатурные синонимы (т.е. основанные на одном типе), которые в iNaturalist случайно считаются разными видами. Как правило, у таких видов совпадает конечный эпитет. Всего обнаружено 27 таких случаев дублирования, для каждого проставлены флаги. И это только те случаи, по которым было дублирование наблюдений по флоре России под двумя названиями. Важно: чтобы не зависеть от скорости решения флагов кураторами (иногда на это уходит годы), наблюдения из дублирующих таксонов были переопределены с примечанием "Чистка" (см., например, https://www.inaturalist.org/observations/20413698).

Впрочем, XX объединений уже произведены кураторами:

Bilacunaria microcarpa
Hippomarathrum microcarpum

Jacobaea erucifolia argunensis
Senecio argunensis

Elymus elongatus
Thinopyrum elongatum

Parasenecio auriculata
Parasenecio auriculatus

Petasites sibiricus
Endocellion sibiricum

Potentilla inquinans
Drymocallis inquinans

Ranunculus sarmentosus
Halerpestes sarmentosa

Eritrichium rupestre
Amblynotus rupestris

Podospermum laciniatum
Scorzonera laciniata

Hemerocallis middendorffii
Hemerocallis middendorfii

Limoniopsis overinii
Limoniopsis owerinii

Vincetoxicum purpureum
Cynanchum purpureum

Tephroseris hyperborealis
Packera hyperborealis

Nitrosalsola laricina
Caroxylon laricinum

Malva transcaucasica
Malvalthaea transcaucasica

Scabiosa olgae
Lomelosia olgae

Peucedanum baicalense
Kitagawia baicalensis

Peucedanum terebinthaceum
Kitagawia terebinthacea

Cerastium dubium
Dichodon viscidum

Helictotrichon compressum
Helictochloa compressa

Helictotrichon hookeri
Helictochloa hookeri

Ещё 6 случаев пока в очереди. Комментарии к флагам от знающих людей приветствуются:

https://www.inaturalist.org/flags/545917 Physocaulis nodosus
Chaerophyllum nodosum
DRAFTED https://www.inaturalist.org/taxon_changes/72684 Arctanthemum arcticum
Chrysanthemum arcticum
DRAFTED https://www.inaturalist.org/flags/546470 Saccharum ravennae
Tripidium ravennae
DRAFTED https://www.inaturalist.org/flags/546468 Bassia hirsuta
Spirobassia hirsuta
DRAFTED https://www.inaturalist.org/flags/546490 Alyssum murale
Odontarrhena muralis
DRAFTED https://www.inaturalist.org/flags/546491 Arabidopsis gemmifera
Arabidopsis halleri gemmifera

Задача второго этапа: проверить таксоны гибридного происхождения, обозначить как гибриды те бинарные названия, которые в базе iNaturalist помечены просто как виды. Такие изменения оформляется как "taxonomic swap" со сменой номера таксона.

https://www.inaturalist.org/flags/546603 Papaver tuberculatum

СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/499479 Nuphar spenneriana
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546598 Spiraea rosalba
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546599 Spiraea pallidiflora
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546600 Gaillardia grandiflora
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546604 Potentilla angarensis
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546605 Rosa majorugosa
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546606 Rubus idaeoides
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546607 Symphyotrichum salignum
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546608 Symphyotrichum versicolor
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546609 Veronica sessiliflora
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546610 Viola contempta
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546611 Viola incissecta
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546612 Viola ruprechtiana

Задача третьего этапа (работа продолжается): исправление родовой принадлежности случайных потеряшек. Как правило, по этим родам были большие таксономические передвижки, но некоторые виды случайно потерялись и остались в старых родах. Пока задокументировано 24 таких случая:

https://www.inaturalist.org/flags/546514 Elymus mucronatus
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546591 Salsola ericoides
https://www.inaturalist.org/flags/546594 Scorzonera ikonnikovii
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546595 Senecio racemosa
https://www.inaturalist.org/flags/510357 Crepis nana
https://www.inaturalist.org/flags/512616 Schizophragma hydrangeoides
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/515542 Potamogeton filiformis
https://www.inaturalist.org/flags/546626 Colpodium variegatum
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546627 Hystrix coreana
https://www.inaturalist.org/flags/546629 Laserpitium stevenii
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546630 Scabiosa austroaltaica
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546630 Scabiosa gumbetica
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546630 Scabiosa isetensis
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546631 Minuartia aizoides
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546631 Minuartia imbricata
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546631 Minuartia laricina
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546631 Minuartia biebersteinii
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546631 Minuartia helmii
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546633 Stipa alpina
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546633 Stipa mongholica
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546634 Podospermum laciniatum
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546634 Podospermum meyeri
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546634 Podospermum purpureum
СДЕЛАНО https://www.inaturalist.org/flags/546636 Angelica sachokiana

Ещё 19 случаев переносов отдельных видов между родами выявлены, но не разрешены, поскольку по ним пока нет консенсуса (например, Lactuca s.l., Crepis s.l., некоторые группы Brassicaceae и проч.). Для двух Polygonum s.l. (Aconogonon) в принятом на iNat роде Koenigia нет опубликованных комбинаций.


Кроме того, некоторое количество изменений запрошены в POWO (это необходимо, поскольку кураторы iNaturalist используют POWO как внешний таксономический хребет):

Исправить в POWO:

1) Anemonoides glabrata should be in Anemonastrum (at least as a synonym)
2) Anemone ochotensis should be in Anemonoides (at least as a synonym)
3) Lycopodium subarcticum should be in Spinulum (at least as a synonym)
4) Lycopodium dubium should be in Spinulum (at least as a synonym)
5) Conioselinum vaginatum and Conioselinum tataricum are always treated as synonyms (both accepted in POWO)
6) Silene repens Patrin and Silene amoena L. are always treated as synonyms (both accepted in POWO)
7) Artemisia viridis Willd. ex DC. (Artemisia rupestris subsp. viridis) is usually accepted
8) Carex ensifolia is a frequently used name, absent in POWO (C. bigelowii group)
9) Alhagi pseudalhagi is a frequently used name, absent in POWO (A. maurorum group)
10) Delphinium cultorum is a frequently used name for garden plants, absent in POWO
11) Malva erecta is a frequently used name, absent in POWO (a synonym of Malva sylvestris L.)

Добавить в POWO и IPNI:

1) Astragalus charadzeae absent in POWO & IPNI
2) Astragalus gulemiensis absent in POWO & IPNI
3) Lactuca abietina absent in POWO & IPNI (a name for Prenathes abietina in Lactuca)
4) Parasenecio tschonoskii absent in POWO & IPNI

Трудные случаи:

1) Ribes maximoviczianum Kom. was published to replace the illegitimate name Ribes maximoviczii Kom. IPNI records should be crosslinked (https://www.ipni.org/n/77205172-1 and https://www.ipni.org/n/792836-1) and the POWO record should be updated.

2) to extract Allium praescissum Rchb. from synonymy of A. paniculatum. This is an easternmost member of the section Codonoprasum growing on saline ground from Volga to Altai (some pics are available here: https://www.plantarium.ru/page/view/item/2127.html for A. praescissum and https://www.plantarium.ru/page/view/item/2110.html for the rest of A. paniculatum).


На следующих этапах планируется сверка таксономических синонимов (основанных на разных типах) и исправление неточной орфографии у некоторых названий в случае необходимости. Это зависит от того, насколько удачным будет опыт первых этапов.

Пожалуйста, пишите в комментариях к этому посту любые накопившиеся вопросы по номенклатуре (в идеале каждый вопрос - один комментарий, чтобы их можно было удалять по мере решения). Особенно интересны случаи очевидного дублирования принятых названий, но не только они.

Ingresado el 04 de octubre de 2021 por apseregin apseregin | 11 comentarios | Deja un comentario